Đảm bảo môi trường học tập an toàn và chăm sóc sức khoẻ, tinh thần cho học sinh là một trong những ưu tiên hàng đầu của Phenikaa School. Nhà trường trang bị hệ thống phòng y tế hiện đại đáp ứng yêu cầu sơ cứu, chăm sóc ban đầu, đảm bảo vệ sinh dịch tễ, an toàn học đường và phòng chống tai nạn thương tích cho học sinh.
Đặc biệt, Phenikaa School có phòng Tư vấn tâm lý học đường với đội ngũ chuyên gia tư vấn tâm lý thân thiện, được đào tạo chuyên sâu giúp hỗ trợ học sinh tối đa các vấn đề tâm lý cá nhân mà các em thường gặp phải trong độ tuổi dậy thì, phối hợp với gia đình, giáo viên, nhân viên và ban giám hiệu nhà trường trong việc tìm kiếm giải pháp đáp ứng các nhu cầu và chăm sóc sức khỏe tinh thần cho học sinh.
Ngoài ra, nhà trường còn thường xuyên mời các chuyên gia có uy tín giúp tổ chức những hoạt động tập thể, chăm sóc sức khỏe vị thành niên, định hướng tâm lý, kỹ năng sống cho học sinh và cả cha mẹ học sinh để cùng phối hợp giáo dục.